内设机构：

1 ．办公室 2 ．组织人事科 3 ．政策法规科 4 ．行政许可服务科（挂外商投资企业登记管理科牌子）5 ．食品监督管理科（挂食品安全综合协调科牌子） 6 ．保健食品化妆品监督管理科 7 ．药品监督管理科（挂不良反应监测中心牌子）8 ．医疗器械监督管理科 9 ．特种设备安全监察科 10 ．质量监督管理与认证科 11 ．标准计量科12 ．市场信用监督管理科 13 ．市场规范监督管理科 14．消费者权益保护科 15．信息化管理科16．计划财务科 17．党办 18．监察室

派出机构：

设城南、城中、城北、黄桥、古溪、广陵、宣堡、河失、新街、虹桥、开发区等11 个市场监督管理分局，挂食品药品安全监管所牌子。